Après la mise en place mécanique des tranchées, l'enregistrement peut commencer. La recherche archéologique étant de nature destructrice et ne pouvant donc être effectuée qu'une seule fois, il est très important que l'enregistrement soit effectué de manière très méticuleuse. Le géomètre localise les tranchées exactement à travers le fossé en utilisant une station totale. Les archéologues photographient les différentes strates, les dessinent à l'échelle 1:20 et décrivent avec précision la couleur, la texture et les éventuelles inclusions. Les découvertes archéologiques, telles que les poteries et les os, sont minutieusement rassemblées par strate. Des échantillons de pollen sont également prélevés dans chaque tranchée et, en cas de présence de paquets organiques, des échantillons pour la recherche archéobotanique et archéozoologique.
